근로기준법상 위약예정은 금지입니다,.
즉 미리 근로계약서에 근로자 손해로 인한것을 급여에서 공제하고 지급하겠다는 것은 위반입니다.
미리 그런내용이 아니고 근로하다가 발생한 손해라면 사업주와 원만하게 이야기해보시는 것이 맞습니다.

출장을 가다가 과속카메라에 찍히면 근로자가 내야하나요? 사업주가 내야하나요?
이런 질문과 비슷합니다.
정답은 없습니다. 근로자가 무조건 그걸 책임지는건 아니지만 과실이 없진 않기에 적정하게 사업주와 이야기를 해보셔야합니다

감사합니다.