근로계약서 미작성은 사업주의 의무사항이므로 근로계약서 미작성 신고에 관하여 근로자에게 불이익이 가는 것은 없습니다. 특히 근로기준법 제104조는 노동청 등에 신고를 이유로 근로자에게 불리한 처우를 할 수 없도록 하고 있으므로, 신고를 이유로 불이익을 주는 것은 근로기준법 위반에 해당합니다.

다만, 보건증 미발급에 관하여는 사업주 뿐만 아니라 근로자에게도 과태료가 부가되니 이 점 유의하시기 바랍니다.