안녕하세요. 청소년근로권익센터입니다.

일반적인 고용노동부에 진정 처리 절차 상, 상기 문제가 발생하기 어렵다고 판단됩니다.
구체적인 사실관계가 확인되어야 더욱 정확한 상담이 필요하다고 사료됩니다만,
사업자등록증 상 사업주로 사건 접수 시 해당 본인이 고용노동부에 출석하여 조사를 받게 되는 것이 원칙입니다.
따라서 실 사업주가 누구인지 판단하는 과정에서 명의상 사업주가 사실관계에 대해 1차적으로 진술하는 절차가 선행되어야 할 것입니다.

또한 사업주가 노무수령 사실을 진술하지 못하더라도 상담자께서 근무사실을 다양한 방법으로 입증, 증명하시게 되면 근로감독관은 체불액을 특정하게 되며, 이후 체불금품확인서를 발급받으실 수 있습니다.
이후 체불금푹확인서 등을 지참하여 법률구조공단의 변호사 지원 등을 통해 민사 소송(소액재판)을 진행하셔야 합니다. 소액재판을 통해 집행권원(판결문 등)을 받으신 후, 근로복지공단에 소액체당금(최종 3월분 체불 임금·휴업수당, 최종 3년분 체불 퇴직금 중 최대 400만원)을 신청하실 수 있습니다.

추가로 궁금하신 사항은 청소년근로권익센터(유선상담1644-3119 카카오톡상담 : id 청소년근로권익센터)를 이용 바랍니다.
청소년근로권익센터는 고용노동부와 한국공인노무사회가 함께 운영하고 있습니다.
고맙습니다.