주휴시간은 원칙적으로 애초에 근로계약시 약정한 시간을 기준으로 하게 됩니다.
다만 약정과 다르게 근무하는 시간이 장기간 계속되는 데도 사업주가 주휴수당을 애초의 계약시간으로 한다면
퇴사시 진정을 통하여 주휴수당을 실제 근무시간에 맞추어 청구할 수도 있습니다
(이런 사건과 관련 유사한 법원의 판례도 있습니다)
대타 상태가 장기간 계속된다면 주휴수당에 대해 사업주에게 건의가 가능하면 해 보시고 불가능하면 퇴사시
진정하는 방법이 있겠습니다.
장기간이 얼마냐 하는 문제는 명확히 나온 것은 없으나 수개월간 지속된다면 해당될 수 있을 것으로 판단됩니다.

추가로 궁금하신 사항은 청소년근로권익센터(유선상담1644-3119 카카오톡상담 : id 청소년근로권익센터)를 이용 바랍니다.
청소년근로권익센터는 고용노동부와 한국공인노무사회가 함께 운영하고 있습니다.
고맙습니다.